Одной из достопримечательностей заповедника является плато Устюрт, состоящее из известняка и мела, при этом оно отливает разными цветами от бледно-розового и голубого до ослепительно-белого.
Ландшафты в заповеднике самые разнообразные: бескрайние степи и пустыни с множеством впадин, где еще можно проследить русла древних вымерших рек. С юго-запада на северо-восток заповедника тянется огромная впадина Кендерли-сор. Днище впадины лежит ниже уровня моря. Именно здесь можно увидеть самые невероятные комбинации фигур, сложенные из чинка.
Растительный мир заповедника не так богат, так как плато Устюрт в основном - это пустыня, испещренная трещинами. Типичными растениями для такой местности являются кактусы, серая полынь, ковыль, боялыч и т.д., также на территории заповедника растет редкий вид растений - заросли туранги.
Фауна заповедника представлена различными видами змей и ящериц, среди которых есть редкие виды гекконов, обитающих только на Устюрте. Среди птиц на территории заповедника преобладают в основном хищники: грифы, балабаны,беркуты, могильники и степные орлы.
На территории заповедника можно встретить волков, шакалов, ласку и степного хорька. Среди парнокопытных наиболее распространёнными животными являются сайгаки, джейраны и устюртские муфлоны (туркменский баран), которые считаются редкими и обитают только на территории Устюрта и Мангышлака.